COVID Virüsü Omicron Varyantı

Omicron varyantı, Antarktika hariç tüm kıtalarda onaylanmıştır.

Omicron, ilk COVID-19 Birkaç gün içinde Dünya Sağlık Örgütü (WHO) tarafından bir endişe varyantına (VOC) yükseltilen varyant, 8 Kasım’da Güney Afrika’daki Lancet Laboratuvarı’nın radarına girdi, ancak bundan şüpheleniliyor. daha erken dolaşıyor.

Mükemmel genomik sürveyans sistemleri nedeniyle, Güney Afrika sağlık yetkilileri bu varyant vakalarını çok hızlı bir şekilde bildirdi. Diğer varyantlardan farklı olarak, Omicron, yayılmasının hızlı bir şekilde izlenmesine izin veren tam genom dizilimi gerektirmeden güvenilir bir PCR testi kullanılarak tespit edilebilir.

Güney Afrika’nın Gauteng eyaletinde, Kasım ayı başlarında kaydedilen 10’dan 23 Kasım’a kadar 1.100 varyant vakası (tüm pozitif vakaların yüzde 73’ü) tespit edildi. 3 Aralık itibariyle, Omicron resmi olarak Güney Afrika’daki Delta varyantını aştı.

Omicron için etkili üreme sayısı (enfekte olmuş tek bir kişi tarafından enfekte olan kişi sayısı) altının üzerinde olduğu tahmin edilirken, Delta için etkili üreme sayısı yaklaşık beş ve su çiçeği gibi çok bulaşıcı bir hastalık için üreme sayısı dokuzdur.

Omicron nerede yayıldı?

Omicron varyantı, Antarktika dışındaki tüm kıtalarda onaylanmıştır. Güney Afrika dışında bildirilen vakalar, bu noktada çoğunlukla seyahatle ilgili görünüyor ve çoğunlukla aşılanmış kişiler arasında. Ancak, topluluk yayılımından şimdiden korkulmaktadır.

Birçok ülke tarafından yapılan projeksiyonlar, Omicron vakalarının yakında Delta vakalarını geçmeye başlayacağını öngörüyor. Ontario’nun sağlık başhekimi 12 Aralık’ta Omicron vakalarının eyaletteki tüm pozitif vakaların yüzde 10’unu oluşturduğunu bildirdi; bu, Omicron’un mevcut azaltılmış sosyal aktivite seviyelerinde bile (pandemi öncesi seviyelerin yüzde 75’i) yüksek oranda bulaşıcı olduğunun bir teyidi ).

Omicron’un diğer varyantlardan farkı nedir?

Varyantlar, virüsün genetik talimatlar dizisi olan virüsün genom dizisindeki mutasyonlar adı verilen değişiklikler veya hatalar yoluyla ortaya çıkar.

Omicron varyantı, virüsün hücrelerimize erişmesini sağlayan anahtar olan virüsün spike proteinini kodlayan gen olan S genindeki diğer varyantlardan önemli ölçüde daha fazla mutasyona sahiptir. Omicron, S genindeki 32 mutasyon da dahil olmak üzere 50 mutasyon biriktirdi. Buna karşılık, Alfa varyantının S geninde dokuz mutasyon vardır ve Delta dokuz ila 13 mutasyona sahiptir.

Her ikisi de orijinal varyanttan daha bulaşıcıdır, sırasıyla yüzde 50 ve yüzde 100 daha fazla bulaşıcıdır ve her ikisi de aşı kaynaklı korumaya bir dereceye kadar meydan okur.

Coronavirüs Mutasyonu COVID Varyantı

Omicron, spike proteinindeki mutasyon sayısındaki diğer varyantlardan farklıdır.

Omicron varyantının ne yapacağını söylemek için henüz çok erken. Proteinler zincirlerden oluştuğu için amino asitlerS genindeki mutasyonlar aminoasitlere yol açacaktır. asit spike proteininde değişikliklere neden olan ikameler. Omicron’un başak proteinindeki amino asit ikamelerinin sayısı ve bunların diğer VOC ve ilgili varyantlarda (VOI) görülenlerle örtüşmesi, bu varyantın başak proteininin aşırı yüklü görünmesini sağlar.

Omicron spike proteini, diğer VOC’de gözlemlenmemiş altı benzersiz amino asit ikamesi, bir veya daha fazla VOC’de görülen yedi ikame, mevcut tüm VOC’de meydana gelen üç ikame ve kalan ikameler çok fazla görülür. diğer varyantlarda daha düşük frekans. Tüm VOC için ortak olan üç amino asit ikamesi, VOC’de bağışıklık kaçışı ve artan bulaşıcılık ve enfeksiyon ile ilişkilidir.

Omicron bir ‘süpervaryant’ mı?

Bir bilim adamı olarak, kafamı bu varyantın etrafına sarmakta zorlanıyorum. Omicron spike proteini, çok kısa gibi görünen bir sürede 32 amino asit ikamesini nasıl biriktirdi ve bu kadar çok ikameyi tek bir proteinde nasıl barındırdı? Bu protein, hücrelerimize erişmek için mükemmel bir anahtar haline geldi ve aynı zamanda kendini antikorlardan kamufle etti mi? Omicron daha ciddi hastalıklara neden olur mu?

SARS-CoV-2 Spike Protein 3D Baskı

COVID-19’a neden olan virüs olan SARS-CoV-2’nin yüzeyindeki bir başak proteininin 3 boyutlu baskısı. Kredi bilgileri: NIH

Omicron’un ne zaman ve nasıl evrimleştiğini yanıtlamak kolay olmayacak, ancak bu varyant tarafından edinilen mutasyonların bilim adamlarının kafalarını kaşıdıkları kesin.

Spike proteindeki çok sayıda amino asit ikamesi dikkate değerdir. Proteinler, bu ikameleri barındırma yeteneklerinde oldukça esnektir ve daha verimli olmalarını sağlar. Ancak bu, mikroba (bu durumda virüs) genellikle ağır bir maliyet getirir çünkü ikameler enerji ve kaynak gerektirir.

İlk olarak, her faydalı mutasyon için, protein yapısının bozulmadan kalmasını sağlamak için gende bir telafi edici mutasyon da meydana gelmelidir.

İkincisi, S geninde bu kadar çok sayıda mutasyonun varlığı, virüsün çoğalma mekanizmasında bu kadar çok hatanın meydana gelmesine izin verecek değişiklikler gerektirecektir. Ancak, bu makineyi değiştirmek, virüs replikasyonu için sorun yaratabilir.

Son olarak, virüs, konakçının özel proteinleri gibi proteinlerini oluşturmak için konağın kaynaklarına güvenir. RNA moleküller (transfer RNA) ve amino asitler. Bu kaynaklar ve potansiyel olarak diğerleri, virüsün taleplerini karşılamayabilir ve arızalanmasına neden olabilir. Yani mutasyona uğramış virüs bir arz-talep sorunuyla karşılaşabilir.

Kısacası, böyle bir “süper mutasyona uğramış” S geninin, virüsün genel uygunluğuna zarar vermesi çok muhtemeldir; süper mutasyona uğramış bir S geninin üretimine uyum sağlamak için başka bir şeyin daha az verimli olması gerekir. Zindelikteki bu kayıp, mikrobiyal dünyada normaldir. Örneğin, bakterilerdeki antimikrobiyal direnç, antibiyotik kullanımıyla sağlanır. Bununla birlikte, onların yokluğunda, bakteriler enerji açısından maliyetli olduğu için bu özelliği sıklıkla kaybederler.

Bu, Omicron varyantının (mevcut gerçek dünya verilerinin gösterdiği gibi) Delta’dan daha bulaşıcı olabileceğini, ancak daha az ciddi hastalığa neden olabileceğini düşündürmektedir. Güney Afrika’dan gelen veriler ve dünya genelinde tespit edilen vakalar, Omicron vakalarının ciddi hastalık ve ölümle ilişkilendirilmediğini gösteriyor.

Aşılar veya önceki enfeksiyon Omicron’a karşı koruma sağlar mı?

Mevcut aşılar, COVID-19 hastalığına, yani hastaneye yatış ve ölüme karşı koruma sağlamak için tasarlandı. Bununla birlikte, daha iyi performans gösterdiler, enfeksiyonları yüzde 80’e kadar azalttılar (mRNA aşıları için) ve bulaşmayı engellediler.

Üç COVID-19 Aşı Dozu

Omicron varyantının, doğal enfeksiyon veya aşı tarafından indüklenen bağışıklık sisteminden kaçıp kaçamayacağı bilinmemektedir.

Omicron varyantının, doğal enfeksiyon veya aşı tarafından indüklenen bağışıklıktan kaçıp kurtulamayacağı bilinmemektedir. Bununla birlikte, henüz akran tarafından gözden geçirilmemiş bir çalışma, Omicron ile yeniden enfeksiyonların, Güney Afrika’daki Beta ve Delta dalgalanmaları sırasında kaydedilenlerden çok daha yüksek olduğunu göstermektedir.

Bu rapor, Beta veya Delta varyantı ile önceki enfeksiyonlar nedeniyle kazanılan bağışıklığın Omicron tarafından enfeksiyonu önlemeyebileceğini düşündürmektedir. Bu bulgu, nüfusun büyük bir bölümünün Alfa, Beta ve Delta dalgalanmalarında enfekte olduğu Güney Afrika’daki Omicron vakalarının hızlı yükselişini açıklayabilir.

Yetersiz veri nedeniyle bu çalışmada Omicron’a karşı aşı kaynaklı bağışıklığın korunması hakkında bir sonuca varılamamıştır; Güney Afrika’da aşılama oranı sadece yüzde 25 civarında. Dünyada meydana gelen Omicron ile ilgili çığır açan vakalar, Omicron’un aşılara enfeksiyon açısından meydan okuyabileceğini düşündürmektedir.

Bir enfeksiyonun asemptomatik veya hafif olabileceğini unutmayın. Güney Afrika’dan gelen son raporların (henüz emsal incelemesi yapılmamış) gösterdiği gibi, aşıların ciddi COVID-19 hastalığına karşı koruma sağlama olasılığı çok yüksektir.

Aşı kaynaklı (veya doğal enfeksiyon) nötralize edici antikorların zamanla azaldığına dair birçok raporun ışığında, Kanada dahil birçok ülke, nüfuslarını olası bir yeniden canlanmaya karşı korumak için takviye aşıları yapmak ve aşı kapsamını artırmak için acele ediyor. Klinik çalışmalarda ve gerçek dünya verilerinde destekleyici aşıların enfeksiyona ve hastalığın ciddiyetine karşı koruma sağladığı gösterilmiştir. Pfizer tarafından yakın zamanda yayınlanan bir rapor, güçlendirici atışın Omicron iletim yörüngesini değiştirebileceğini belirtti.

Yakın gelecekte Omicron için olası olan nedir?

Dünyanın dört bir yanındaki birçok laboratuvar, Omicron’un bulaşıcılığı, virülansı, neden olabileceği hastalığın şiddeti ve aşı kaynaklı korumadan kaçma yeteneği açısından nerede durduğunu değerlendiriyor. Yani, şimdilik, bu bir bekleme oyunu.

Burada, Kanada’da, uygun nüfus için aşı kapsamını yüzde 90 ve üzerine çıkarmaya devam etmeliyiz. Aşılar işe yarıyor!

Beş ila 11 yaş arası çocuklar için aşıların onaylanması, kuşkusuz aşı kapsamını daha da artıracak ve Omicron bulaşma yolunu değiştirecektir.

Aynı zamanda halk sağlığı önlemlerine devam etmeliyiz: yüz maskeleri (gerçek dünya verileri virüsün yayılmasını yüzde 53 oranında engellediğini gösteriyor), fiziksel mesafe (COVID-19 hava yoluyla bulaşan bir hastalıktır), el hijyeni ve büyük toplantılar, özellikle kapalı mekanlarda.

Son olarak ve eşit derecede önemli olan, Omicron varyantının ortaya çıkması, bize bir kez daha, gelişmekte olan ülkelere aşı kampanyalarında yardım etmenin ne kadar kritik olduğunu hatırlatıyor. Virüs, dünyanın herhangi bir yerinde gelişmek için verimli bir zemin bulduğu sürece, gelişmiş ülkelerin aşılama yoluyla kaydettiği ilerlemeye meydan okumaya devam edecektir.

Dasantila Golemi-Kotra, Profesör, Biyoloji, York Üniversitesi, Kanada tarafından yazıldı.

Bu makale ilk olarak The Conversation’da yayınlandı.Konuşma





#Bir #Süper #Varyant #mı #Aşılardan #Kurtulabilir #Kadar #Bulaşabilir