Dünya DNA Genetiği

Earlham Enstitüsü (EI), Birleşik Krallık biyobilim topluluğuna biyolojik çeşitlilik genomiği için kritik teknolojiler sağlayarak, Earth BioGenome projelerini desteklemek için son teknoloji Pacific Biosciences Sequel IIe platformlarının ikiz seti ile yüksek doğrulukta uzun okuma dizileme kapasitesini artırdı. .

Dünya BiyoGenom Projesi (EBP), önümüzdeki on yıl içinde Dünya’daki tüm ökaryotik biyoçeşitliliğin genomlarını sıralamak, kataloglamak ve karakterize etmek için ivme kazanırken, çok sayıda yüksek veriyi hızla sunabilen teknoloji ve altyapıyı yerleştirmek için küresel çabalar devam etmektedir. -kaliteli genom dizileri.

Sequel IIe platformu, bilim insanlarının genomik analizi daha yüksek bir seviyeye taşımasını sağlar. kesinlik genomları ve transkriptomları çözmek için aslına uygun uzun okumalar (HiFi) üreterek.

Earlham Enstitüsü Genomik Boru Hatları Başkanı Dr. Karim Gharbi, “Sequel IIe platformları, BioGenome dizilimine olan katkımızda mevcut altyapımızı büyütmemize izin veriyor” dedi. “Birleşik Krallık biyobilim topluluğundan gelen yüksek kaliteli genom referanslarına olan talep, tüm zamanların en yüksek seviyesindeki HiFi dizi verilerine erişim talepleriyle birlikte hızla artıyor.

Earlham Enstitüsünde Sequel IIe Platformları

Earlham Enstitüsü’nde Sequel IIe platformları. Kredi: Earlham Enstitüsü (EI)

“Genom bilimi topluluğu genelinde Sequel IIe’yi ilk benimseyenlerden gelen geri bildirimler, HiFi genomlarıyla son derece olumlu oldu ve mevcut kaynakları en az bir büyüklük sırasına göre geride bıraktı. Ek platform, EI araştırmacıları ve Birleşik Krallık biyo-bilimcileri için HiFi okumalarına sürekli, uygun maliyetli erişim sağlayarak genom dizisi kapasite kapasitemizi hemen ikiye katlayacak.”

Geçtiğimiz birkaç yıl içinde, Earlham Enstitüsü, yüksek kaliteli, zengin açıklamalı genom dizilerinin artık istisna değil, giderek norm haline geldiği biyolojide yeni bir çağın yolunu belirleyerek genomu etkinleştiren teknolojilere stratejik yatırımlar yaptı.

Earlham Enstitüsü Müdürü Prof Neil Hall şunları ekledi: “Dünya BioGenome proje girişimleri son derece işbirlikçidir, ancak yüksek kaliteli genomları ölçekte üretebilecek teknoloji ve altyapının sağlanması gerekiyor. Protist genomlarının analizi için Earlham Enstitüsü’ndeki ek HiFi kapasitesi, genom dizilemede lider olarak küresel girişimdeki konumumuzu güçlendiriyor.”

Bu dizileme teknolojileri, temel araştırma ortağı olarak Earlham Enstitüsü ile çeşitli ulusal ve uluslararası girişimleri desteklemektedir. Omurgalı Genomları Projesi, Darwin Hayat Ağacı (DTOL) Projesi ve Avrupa Referans Genom Atlası (ERGA) dahil çok çeşitli organizmalar için önemli sıralama verileri ve analizler sunar ve tek hücreli ökaryotların (protistler) biyolojik çeşitliliğini kataloglamak için iddialı programı destekler.*

Dr. Gharbi, “Bu yatırımın anahtarı, uzun, yüksek kaliteli (HiFi) dizileme platformunun (Pacific Biosciences Sequel II) 2019’da, Earlham Enstitüsü’nün BBSRC fonunun desteğiyle cihazı kalıcı olarak satın almasından önce erken benimsenmesiydi” diye ekledi. “Bu teknoloji, Enstitü araştırmacılarının, kilit hedef türler için yüksek kaliteli genom referansları sağlamada erken başarıyı güvence altına almalarına ve BioGenom araştırmalarında EI’yi lider bir merkez haline getirmelerine olanak sağladı.”

notlar

*Wellcome tarafından finanse edilen DToL projesinin bir parçası olarak Earlham Enstitüsü, tek hücreli ökaryotlardan yüksek kaliteli genomlar oluşturmak için yeni araçların geliştirilmesine de öncülük ediyor. Verimliliği artırmak ve bireysel hücrelerden kitaplık hazırlama maliyetini azaltmak için çevresel popülasyonlardan izole edilen protist türler için platformlar ve boru hatları bu teknolojinin önemli bir parçasıdır.





#Yeni #Teknoloji #Dünyadaki #Tüm #Yaşamın #Genomunun #Kodunu #Çözmeye #Yardımcı #Olmak #İçin #Sıralama #Gücünü #Artırıyor